La historia de San Francisco Gotera es un relato fascinante que se remonta a siglos atrás y abarca una rica herencia cultural y acontecimientos históricos significativos. Esta encantadora ciudad, ubicada en el este de El Salvador, ha desempeñado un papel importante en la historia del país y ha dejado una huella imborrable en la memoria colectiva de sus habitantes.
A partir de 1888 se fundo la conocida Parroquia del lugar; sin embargo se conoce que en 1803 ya se registraban los feligreses en las actividades de Bautismos.
Por otra parte debido al conflicto armado, se manifestó que en esta Parroquia se resguardara la información de las iglesias de otros municipios, estos fueron: Yoloaiquin, Cacaopera, San Carlos, Chilanga, Lolotiquillo, Guatajiagua y Sociedad. Estas últimas trasladaron la documentación a sus Parroquias de origen.